Hot-keys on this page

r m x p   toggle line displays

j k   next/prev highlighted chunk

0   (zero) top of page

1   (one) first highlighted chunk

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

13

14

15

16

17

18

19

20

21

22

23

24

25

26

27

28

29

30

31

32

33

34

35

36

37

38

39

40

41

42

43

44

45

46

47

48

49

50

51

52

53

54

55

56

57

58

59

60

61

62

63

64

65

66

67

68

69

70

71

72

73

74

75

76

77

78

79

80

81

82

83

84

85

86

87

88

89

90

91

92

93

94

95

96

97

98

99

100

101

102

103

104

105

106

107

108

109

110

111

112

113

114

115

116

117

118

119

120

121

122

123

124

125

126

127

128

129

130

131

132

133

134

135

136

137

138

139

140

141

142

143

144

145

146

147

148

149

150

151

152

153

154

155

156

157

158

159

160

161

162

163

164

165

166

167

168

169

170

171

172

173

174

175

176

177

178

179

180

181

182

183

184

185

186

187

188

189

190

191

192

193

194

195

196

197

198

199

200

201

202

203

204

205

206

207

208

209

210

211

212

213

214

215

216

217

218

219

220

221

222

223

224

225

226

227

228

229

230

231

232

233

234

235

236

237

238

239

240

241

242

243

244

245

246

247

248

249

250

251

252

253

254

255

256

257

258

259

260

261

262

263

264

265

266

267

268

269

270

271

# -*- coding: utf-8 -*- 

 

from obspy import UTCDateTime, read, Trace 

from obspy.core.util import NamedTemporaryFile 

from obspy.sh.core import readASC, writeASC, isASC, isQ, readQ, writeQ, \ 

    STANDARD_ASC_HEADERS 

import numpy as np 

import os 

import unittest 

import warnings 

 

 

class CoreTestCase(unittest.TestCase): 

    """ 

    """ 

    def setUp(self): 

        # Directory where the test files are located 

        self.path = os.path.dirname(__file__) 

 

    def test_read101Traces(self): 

        """ 

        Testing reading Q file with more than 100 traces. 

        """ 

        testfile = os.path.join(self.path, 'data', '101.QHD') 

        # read 

        stream = readQ(testfile) 

        stream.verify() 

        self.assertEqual(len(stream), 101) 

 

    def test_isASCFile(self): 

        """ 

        Testing ASC file format. 

        """ 

        testfile = os.path.join(self.path, 'data', 'TEST_090101_0101.ASC') 

        self.assertEqual(isASC(testfile), True) 

        testfile = os.path.join(self.path, 'data', 'QFILE-TEST-SUN.QHD') 

        self.assertEqual(isASC(testfile), False) 

 

    def test_isQFile(self): 

        """ 

        Testing Q header file format. 

        """ 

        testfile = os.path.join(self.path, 'data', 'QFILE-TEST-SUN.QHD') 

        self.assertEqual(isQ(testfile), True) 

        testfile = os.path.join(self.path, 'data', 'QFILE-TEST-SUN.QBN') 

        self.assertEqual(isQ(testfile), False) 

        testfile = os.path.join(self.path, 'data', 'TEST_090101_0101.ASC') 

        self.assertEqual(isQ(testfile), False) 

 

    def test_readSingleChannelASCFile(self): 

        """ 

        Read ASC file test via obspy.sh.core.readASC. 

        """ 

        testfile = os.path.join(self.path, 'data', 'TEST_090101_0101.ASC') 

        # read 

        stream = readASC(testfile) 

        stream.verify() 

        self.assertEqual(stream[0].stats.delta, 5.000000e-02) 

        self.assertEqual(stream[0].stats.npts, 1000) 

        self.assertEqual(stream[0].stats.starttime, 

                         UTCDateTime(2009, 1, 1, 1, 1, 1)) 

        self.assertEqual(stream[0].stats.channel, 'BHZ') 

        self.assertEqual(stream[0].stats.station, 'TEST') 

        self.assertEqual(stream[0].stats.calib, 1.0e-00) 

        # check last 4 samples 

        data = [2.176000e+01, 2.195485e+01, 2.213356e+01, 2.229618e+01] 

        np.testing.assert_array_almost_equal(stream[0].data[-4:], data) 

 

    def _compareStream(self, stream): 

        """ 

        Helper function to verify stream from file 'data/QFILE-TEST*'. 

        """ 

        # channel 1 

        self.assertEqual(stream[0].stats.delta, 5.000000e-02) 

        self.assertEqual(stream[0].stats.npts, 801) 

        self.assertEqual(stream[0].stats.sh.COMMENT, 

                         'TEST TRACE IN QFILE #1') 

        self.assertEqual(stream[0].stats.starttime, 

                         UTCDateTime(2009, 10, 1, 12, 46, 1)) 

        self.assertEqual(stream[0].stats.channel, 'BHN') 

        self.assertEqual(stream[0].stats.station, 'TEST') 

        self.assertEqual(stream[0].stats.calib, 1.500000e+00) 

        # check last 4 samples 

        data = [-4.070354e+01, -4.033876e+01, -3.995153e+01, -3.954230e+01] 

        np.testing.assert_array_almost_equal(stream[0].data[-4:], data, 5) 

        # channel 2 

        self.assertEqual(stream[1].stats.delta, 5.000000e-02) 

        self.assertEqual(stream[1].stats.npts, 801) 

        self.assertEqual(stream[1].stats.sh.COMMENT, 

                         'TEST TRACE IN QFILE #2') 

        self.assertEqual(stream[1].stats.starttime, 

                         UTCDateTime(2009, 10, 1, 12, 46, 1)) 

        self.assertEqual(stream[1].stats.channel, 'BHE') 

        self.assertEqual(stream[1].stats.station, 'TEST') 

        self.assertEqual(stream[1].stats.calib, 1.500000e+00) 

        # check first 4 samples 

        data = [-3.995153e+01, -4.033876e+01, -4.070354e+01, -4.104543e+01] 

        np.testing.assert_array_almost_equal(stream[1].data[0:4], data, 5) 

        # channel 3 

        self.assertEqual(stream[2].stats.delta, 1.000000e-02) 

        self.assertEqual(stream[2].stats.npts, 4001) 

        self.assertEqual(stream[2].stats.sh.COMMENT, '******') 

        self.assertEqual(stream[2].stats.starttime, 

                         UTCDateTime(2010, 1, 1, 1, 1, 5, 999000)) 

        self.assertEqual(stream[2].stats.channel, 'HHZ') 

        self.assertEqual(stream[2].stats.station, 'WET') 

        self.assertEqual(stream[2].stats.calib, 1.059300e+00) 

        # check first 4 samples 

        data = [4.449060e+02, 4.279572e+02, 4.120677e+02, 4.237200e+02] 

        np.testing.assert_array_almost_equal(stream[2].data[0:4], data, 4) 

 

    def test_readAndWriteMultiChannelASCFile(self): 

        """ 

        Read and write ASC file via obspy.sh.core.readASC. 

        """ 

        origfile = os.path.join(self.path, 'data', 'QFILE-TEST-ASC.ASC') 

        # read original 

        stream1 = readASC(origfile) 

        stream1.verify() 

        self._compareStream(stream1) 

        # write 

        tempfile = NamedTemporaryFile().name 

        writeASC(stream1, tempfile, STANDARD_ASC_HEADERS + ['COMMENT']) 

        # read both files and compare the content 

        text1 = open(origfile, 'rt').readlines() 

        text2 = open(tempfile, 'rt').readlines() 

        self.assertEquals(text1, text2) 

        # read again 

        stream2 = readASC(tempfile) 

        stream2.verify() 

        self._compareStream(stream2) 

        os.remove(tempfile) 

 

    def test_readAndWriteMultiChannelASCFileViaObsPy(self): 

        """ 

        Read and write ASC file test via obspy.core. 

        """ 

        origfile = os.path.join(self.path, 'data', 'QFILE-TEST-ASC.ASC') 

        # read original 

        stream1 = read(origfile, format="SH_ASC") 

        stream1.verify() 

        self._compareStream(stream1) 

        # write 

        tempfile = NamedTemporaryFile().name 

        hd = STANDARD_ASC_HEADERS + ['COMMENT'] 

        stream1.write(tempfile, format="SH_ASC", included_headers=hd) 

        # read again w/ auto detection 

        stream2 = read(tempfile) 

        stream2.verify() 

        self._compareStream(stream2) 

        os.remove(tempfile) 

 

    def test_readAndWriteMultiChannelQFile(self): 

        """ 

        Read and write Q file via obspy.sh.core.readQ. 

        """ 

        #1 - little endian (PC) 

        origfile = os.path.join(self.path, 'data', 'QFILE-TEST.QHD') 

        # read original 

        stream1 = readQ(origfile) 

        stream1.verify() 

        self._compareStream(stream1) 

        # write 

        tempfile = NamedTemporaryFile(suffix='.QHD').name 

        writeQ(stream1, tempfile, append=False) 

        # read again 

        stream2 = readQ(tempfile) 

        stream2.verify() 

        self._compareStream(stream2) 

        # remove binary file too (dynamically created) 

        os.remove(os.path.splitext(tempfile)[0] + '.QBN') 

        os.remove(tempfile) 

        #2 - big endian (SUN) 

        origfile = os.path.join(self.path, 'data', 'QFILE-TEST-SUN.QHD') 

        # read original 

        stream1 = readQ(origfile, byteorder=">") 

        stream1.verify() 

        self._compareStream(stream1) 

        # write 

        tempfile = NamedTemporaryFile(suffix='.QHD').name 

        writeQ(stream1, tempfile, byteorder=">", append=False) 

        # read again 

        stream2 = readQ(tempfile, byteorder=">") 

        stream2.verify() 

        self._compareStream(stream2) 

        # remove binary file too (dynamically created) 

        os.remove(os.path.splitext(tempfile)[0] + '.QBN') 

        os.remove(tempfile) 

 

    def test_readAndWriteMultiChannelQFileViaObsPy(self): 

        """ 

        Read and write Q file test via obspy.core. 

        """ 

        #1 - little endian (PC) 

        origfile = os.path.join(self.path, 'data', 'QFILE-TEST.QHD') 

        # read original 

        stream1 = read(origfile, format="Q") 

        stream1.verify() 

        self._compareStream(stream1) 

        # write 

        tempfile = NamedTemporaryFile(suffix='.QHD').name 

        stream1.write(tempfile, format="Q", append=False) 

        # read again w/ auto detection 

        stream2 = read(tempfile) 

        stream2.verify() 

        self._compareStream(stream2) 

        # remove binary file too (dynamically created) 

        os.remove(os.path.splitext(tempfile)[0] + '.QBN') 

        os.remove(tempfile) 

        #2 - big endian (SUN) 

        origfile = os.path.join(self.path, 'data', 'QFILE-TEST-SUN.QHD') 

        # read original 

        stream1 = read(origfile, format="Q", byteorder=">") 

        stream1.verify() 

        self._compareStream(stream1) 

        # write 

        tempfile = NamedTemporaryFile(suffix='.QHD').name 

        stream1.write(tempfile, format="Q", byteorder=">", append=False) 

        # read again w/ auto detection 

        stream2 = read(tempfile, byteorder=">") 

        stream2.verify() 

        self._compareStream(stream2) 

        # remove binary file too (dynamically created) 

        os.remove(os.path.splitext(tempfile)[0] + '.QBN') 

        os.remove(tempfile) 

 

    def test_skipASClines(self): 

        testfile = os.path.join(self.path, 'data', 'QFILE-TEST-ASC.ASC') 

        # read 

        stream = readASC(testfile, skip=100, delta=0.1, length=2) 

        stream.verify() 

        # skip force one trace only 

        self.assertEqual(len(stream), 1) 

        # headers 

        self.assertEqual(stream[0].stats.delta, 1.000000e-01) 

        self.assertEqual(stream[0].stats.npts, 2) 

        # check samples 

        self.assertEqual(len(stream[0].data), 2) 

        self.assertAlmostEqual(stream[0].data[0], 111.7009, 4) 

        self.assertAlmostEqual(stream[0].data[1], 119.5831, 4) 

 

    def test_writeSmallTrace(self): 

        """ 

        Tests writing Traces containing 0, 1 or 2 samples only. 

        """ 

        for format in ['SH_ASC', 'Q']: 

            for num in range(0, 4): 

                tr = Trace(data=np.arange(num)) 

                tempfile = NamedTemporaryFile().name 

                if format == 'Q': 

                    tempfile += '.QHD' 

                tr.write(tempfile, format=format) 

                # test results 

                with warnings.catch_warnings() as _: 

                    warnings.simplefilter("ignore") 

                    st = read(tempfile, format=format) 

                self.assertEquals(len(st), 1) 

                self.assertEquals(len(st[0]), num) 

                # Q files consist of two files - deleting additional file 

                if format == 'Q': 

                    os.remove(tempfile[:-4] + '.QBN') 

                    os.remove(tempfile[:-4]) 

                os.remove(tempfile) 

 

 

def suite(): 

    return unittest.makeSuite(CoreTestCase, 'test') 

 

 

if __name__ == '__main__': 

    unittest.main(defaultTest='suite')